基础卵泡数量检查的最佳时间是在月经周期的第2-5天，此时卵巢内的卵泡尚未开始发育，可以准确地反映出卵巢的基础状态。这一时期被称为“卵泡早期”，是评估卵巢储备功能的重要窗口。

选择月经周期的早期进行检查，能够避免因排卵后黄体期的影响而造成的结果偏差。此外，这一阶段的血液激素水平也相对稳定，有利于同步检测性激素水平，如FSH（促卵泡生成素）、LH（促黄体生成素）和E2（雌二醇），以全面了解卵巢功能。

进行基础卵泡数量检查通常采用超声波检查，医生会通过阴道超声观察卵巢内直径小于10毫米的小卵泡数目。结合血液中的性激素检测结果，可以综合判断女性的生育潜力及卵巢衰老程度。

需要注意的是，不同个体之间存在差异，因此最好遵医嘱，在专业医生指导下确定最适合自己的检查时间。如果计划怀孕或存在不孕不育问题，建议定期监测卵泡发育情况，以便及时调整治疗方案。